Le BFEA participe, avec la DIRNAV et la DIRCAM, à la cohérence de la DSAÉ en apportant une expertise dans les domaines de l’exploitation et de la formation. Il permet ainsi une approche globale de la sécurité, en particulier dans le domaine de sa promotion. Bien que n’ayant pas de pouvoir règlementaire, le BFEA facilite l’appréhension des attentes des autorités d'emploi, notamment dans des domaines transverses comme celui des drones. Dans le domaine de la formation, il permet de parler d’une seule voix à l’aviation civile, apportant ainsi force et cohérence à la position du ministère des armées. Pour l’exploitation, son expertise en matière d’affrètement et de location est maintenant unanimement reconnue.